Η Διεύθυνση Εκπαίδευσης είναι αρμόδια για τον συντονισμό και τη σύνδεση μεταξύ του διοικητικού και του ακαδημαϊκού τομέα λειτουργίας του Πανεπιστημίου καθώς και για την στήριξη των ακαδημαϊκών μονάδων σε διοικητικά θέματα. Υποστηρίζει τις Προπτυχιακές, Μεταπτυχιακές και Διδακτορικές σπουδές των ακαδημαϊκών τμημάτων και τη Μεταδιδακτορική Έρευνα συντονίζοντας θέματα κοινού ενδιαφέροντος. Επιπλέον, μεριμνά για την κατοχύρωση της πνευματικής ιδιοκτησίας του Πανεπιστημίου.
Αποστολή της Διεύθυνσης Εκπαίδευσης του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων είναι: α) η μεθοδική και αποτελεσματική διαχείριση των ακαδημαϊκών και εκπαιδευτικών θεμάτων που αφορούν στα Προγράμματα Σπουδών, β) η ποιοτική υποστήριξη του εκπαιδευτικού έργου, γ) η ανάδειξη και προβολή του πνευματικού έργου του Ιδρύματος στο εσωτερικό και εξωτερικό.